В 1825 году среди русских отдыхающих родилась идея построить в Мариенбаде (ныне Марианске-Лазне, Чехия) православный храм. Они провели первый сбор средств. Воплотить идею не удалось. Все собранные средства были переданы на возведение католического храма Вознесения Девы Марии. В 1860 году в одном из зданий была устроена небольшая часовня. В 1878 году она разместилась на первом этаже городской ратуши, а в ноябре 1880 года в ней поставили «походную» Никольскую церковь. После переноса последней в Ниццу 15 (27) июля 1882 года здесь была освящена новая церковь.
Богослужения совершал священник, приезжавший из Веймара на время курортного сезона.
Одновременно в 1881 году с целью строительства отдельного храма был учреждён специальный комитет, который организовал сбор средств. В 1891 году банк, в котором находились вклады Комитета, обанкротился. Новому комитету удалось собрать большую сумму. Председателем одновременно созданного в Санкт-Петербурге Церковно-строительного комитета состоял граф И. И. Воронцов-Дашков.
В июле 1899 года был подобран для строительства храма участок площадью около 800 квадратных метров, расположенный на лесистом склоне холма Сухи Вршек, между гостиницей «Казино» и англиканской церковью.
Закладка храма состоялась 11 (23) июля 1900 года, освящение протоиереем Алексеем Мальцевым — 25 июня (8 июля) 1902 года. Строительными работами руководил Густав Видерман, автором проекта является Н. В. Султанов.
Храм не имел своего прихода, он был приписан к Дрезденской церкви, а с 1906 года — к Веймарской. С началом Первой мировой войны богослужения проводились редко.
В 1920-е — 1930-е годы храм состоял в юрисдикции епископа Пражского Сергия (Королева) (впоследствии архиепископ Казанский и Чистопольский). Богослужения совершались только в летний период.
Вскоре после создания Протектората Богемии и Моравии, распоряжением Рейхсминистра церковных дел Ганса Керрла от 5 мая 1939 года приход со всем его имуществом был передан Берлинской и Германской епархии Русской Православной Церкви Заграницей. В период Второй мировой войны в церкви служило несколько православных священнослужителей, среди которых — архиепископ Александр (Иноземцев).
Регулярный православный приход при храме был образован в 1945 году, когда в Марианско-лазенскую область прибыли переселенцы — православные чехи из Волыни. В том же году храм перешёл в Западноевропейский экзархат Московского Патриархата, а с 1946 года — в Чехословацкий экзархат.
С получением автокефалии в 1951 году Чехословацкой Православной Церковью храм перешёл в её юрисдикцию.
В 1990 года при храме был основан православный факультет богословия.
В настоящее время храм относится к Карловарскому пресвитериату (благочинию) Пражской епархии Православной Церкви Чешских земель и Словакии. Настоятель — протоиерей Йозеф Гаузар.